Тромбоз, гемостаз и реология. — 2017. — №1(69). — С. 67-76.

ДЕТЕРМИНАЦИЯ ГОМОЛОГИЧНЫХ ФРАГМЕНТОВ В СТРУКТУРЕ БЕЛКОВ ВИРУСОВ ГРИППА А(Н1N1) pdm09 2009 И 2016 ГОДОВ ВЫДЕЛЕНИЯ И БЕЛКОВ СИСТЕМЫ ГЕМОСТАЗА ЧЕЛОВЕКА

И.Н. Жилинская¹, А.В. Фадеев¹, А.А. Азаренок¹, А.Р. Прочуханова¹, Е.П. Харченко²

ФГБУ «Научно-исследовательский институт гриппа» Министерства здравоохранения Российской Федерации¹; ФГБУН «Институт эволюционной физиологии и биохимии имени И.М. Сеченова» РАН²; Санкт-Петербург, Россия

Проведен компьютерный поиск и сравнительный анализ гомологичных фрагментов белков вирусов гриппа А(Н1N1) pdm09 2009 и 2016 годов выделения и белков системы гемостаза. В структуре белков вируса гриппа 2016 года выявлено 10 новых и дополнительных гомологичных фрагментов аминокислотной последовательности при отсутствии двух ранее выявленных в вирусе 2009 года фрагментов. Можно сделать вывод об усилении гомологии с белками гемостаза в структуре вируса гриппа 2016 года по сравнению с вирусом 2009 года; особенно это касается факторов коагуляции V (в НА и NS1), VIII (в РВ2), ХI (в NS1) и фактора Виллебранда (в NА). Появление у выделенного в эпидемию 2016 года в России вируса гриппа мутаций в генах, кодирующих внутренние и поверхностные белки, усиливающих мимикрию с белками системы гемостаза человека, возможно способствовало сохранению высокого уровня вирулентности, сопоставимого с уровнем вирулентности вируса гриппа, выделенного в 2009–2011 годах.

Ключевые слова: вирус гриппа — вирус Эбола — белки — гемостаз.

Для корреспонденции

Жилинская Ирина Николаевна — д.б.н., в.н.с. лаборатории молекулярной вирусологии и генной инженерии ФГБУ «НИИ гриппа» МЗ РФ.

E-mail: irina@influenza.spb.ru

Статья поступила 10.06.2016, принята к печати 27.01.2017.

IDENTIFICATION OF PROTEINS STRUCTURE HOMOLOGY OF INFLUENZA VIRUS А(Н1N1) pdm09 ISOLATED IN 2009 AND 2016 WITH HUMAN HEMOSTASIS PROTEINS

I.N. Zhilinskaya¹, A.V. Fadeev¹, A.A. Azarenok¹, A.P. Prochukhanova¹, E.P. Kharchenko²

Research Institute of Influenza, Health Ministry of Russian Federation¹; Institute of Evolutionary Physiology and Biochemistry named after I.M. Sechenov RAS²; Saint-Petersburg, Russia

We performed protein structure comparison of infl uenza virus A(H1N1) pdm09 isolated in 2009 and 2016 with hemostatic proteins. In the 2016 isolate we revealed 10 new and additional homologous amino acid segments without 2 segments previously found in the 2009 isolate. We conclude that the 2016 isolate is more homologous with hemostatic proteins than the 2009 isolate, especially with coagulation factor V (in HA and NS1), VIII (iв РВ2), ХI (in NS1) and von Willebrand factor (in NA). Thus the high virulence of the 2016 isolate which is comparable with that of the 2009 isolate can be attributed to the said mutations in surface and internal protein genes of the 2016 isolate which increase mimicry with hemostatic proteins.

Key words: influenza virus — Ebola virus — proteins — hemostasis.